研究表明 R-loops 与 SOX2 协调调节重编程为多能性

R 环是细胞中的独特结构，由 RNA-DNA 杂交体和移位的单链 DNA 组成，通常在转录基因周围发现。然而，R-loops 也是动态和广泛存在的实体，在基因组中发挥着不明确的调控和表观遗传作用。

中国科学院广州生物医药与健康研究院 (GIBH) 的研究人员最近在线发表在《科学进展》(Science Advances) 上的一项研究揭示了 R-loops 在体细胞重编程为诱导多能性细胞中的活性干细胞(iPSC)。他们揭示了 R-loops 影响体细胞重编程为 iPSCs，破坏这种活动会导致体细胞重编程为 iPSCs 的缺陷。

R-loops 可以通过改变转录因子结合、染色质修饰和 DNA 甲基化来充当表观遗传标记。研究人员绘制了 OSKM(Oct4、Sox2、Klf4 和 c-Myc，重编程鸡尾酒中的四种转录因子)介导的体细胞重编程期间 R-loops 的图谱，并显示了 R-loop 形成和溶解与过程之间的动态关联体细胞重编程。

“我们的数据表明，R-loops 在重编程的早期和晚期都会引起急剧变化，但它们在中间阶段会发生短暂而细微的变化，这表明重编程过程中染色质开放、DNA 甲基化和基因表达的模式相似”，来自 GIBH 的这项研究的作者姚宏杰说。

YAO 和他的同事发现一些 R-loops 在基因表达之前形成，这表明 R-loops 正在为转录做好准备。他们的研究表明，转录因子 Sox2(但不是重编程鸡尾酒中的任何其他 Yamanaka 因子)与 R 环形成复合物密切相关。