明尼苏达大学的研究人员成功绘制了濒临灭绝的普氏野马的完整基因组图谱。该物种一度在野外灭绝,但由于保护工作,目前种群数量约为 2,000 头。
这项研究发表在《G3:基因、基因组、遗传学》杂志上,由兽医学院的研究人员 Nicole Flack 和 Lauren Hughes 以及食品、农业和自然资源科学学院的教授 Christopher Faulk 领导。密歇根大学的学生通过 Faulk 的动物科学课程为基因组测序做出了贡献。
“基因组是动物的基本蓝图,它告诉我们是什么让一个物种如此独特,也告诉我们一个种群的健康状况,”福克说。“我的学生们齐心协力,制作出了世界上最高质量的普氏野马基因组。”
研究人员现在可以利用这一点作为工具,准确预测基因突变对普氏野马的健康和保护意味着什么。
“在没有良好参考的情况下研究基因就像是在没有盒子上的图片的情况下拼 30 亿块拼图,”弗莱克说。“研究重要基因突变的普氏野马研究人员需要一张良好的参考图片来与他们的拼图进行比较。”
研究人员利用明尼苏达州动物园一匹 10 岁普氏野马母马瓦鲁什卡的血液样本,绘制了该物种的代表性基因图谱。该动物园长期以来一直积极进行普氏野马的繁殖和管理,自 1970 年代以来已产下 50 多匹小马驹。
明尼苏达动物园兽医学博士安妮·里瓦斯 (Anne Rivas) 表示:“我们很高兴与明尼苏达大学合作,在动物园和野外,随着马群数量不断恢复,保护马的基因健康。我们很高兴为社区提供机会,让我们看到马作为我们保护工作的成果。”
用于构建基因组的尖端测序技术使用一台大约相当于汽水罐大小的小型机器。它的便携性意味着这种方法可以用于进一步研究偏远地区的野生普氏野马。
参考基因组的未来应用可能包括研究帮助马适应环境变化的基因、识别与特定性状或疾病相关的突变,以及为未来的育种决策提供信息以帮助改善遗传多样性。
鉴于普氏野马濒临灭绝期间出现的极端种群瓶颈,这种理解对于持续的繁殖工作至关重要。